薄層色譜掃描儀由光源、光學采樣系統、薄層色譜作站三大分組成，作站控制儀器可對薄層色譜行采樣并對斑點行定量處理，定量度與口產品相近。HAD-2005型薄層色譜掃描系統的使用成本低。可滿足藥廠、校日常分析的需要，省時省力是您實驗室的好助手。
薄層色譜掃描儀的使用有時會出現稍許誤差，誤差包括三個方面：點樣誤差、展開誤差、定位誤差和檢測誤差。
采用自動點樣器，誤差可控制在0.5%，熟練的分析人員用毛細管點樣，誤差小于1.0%，若用微量樣器，誤差會大些。
展開誤差來自鋪板的均勻性和樣品展開效果，若采用預制的薄層板，誤差會明顯降低，采用雙波長鋸齒掃描，也能有效降低展開誤差。
定位誤差值斑點的位置和大小判定，擴散、脫尾等易產生定位誤差。檢測誤差來自光源的穩定性、光檢測器的穩定性以及樣品對光吸收（或熒光產生）的線性度等方面。為減少這些誤差，需要非常的機電系統，這也直接導致產品昂的價格。
通常情況下，薄層掃描分析的誤差在3%以下。
薄層數碼成像分析是利用數碼成像設備獲得薄層板上各點的光強度信息，之后對獲得圖像行分析的薄層分析。數碼成像設備包括兩種：照相機和掃描儀（由于數碼掃描儀采用逐行成像，為便于區分傳統薄層掃描儀的逐點掃描，將數碼掃描儀稱為逐行掃描儀）。
和傳統薄層掃描樣，照相機或逐行掃描儀都具有光檢測系統，它們都是將光量線性轉化為電信號的元件。不同的是，照相機和逐行掃描儀可步將電信號轉換成電腦圖像，圖像中單個點（像素）的顏色深淺反映了光的強弱。
因此，薄層數碼成像更接近人眼觀察檢測，結果更直觀，因此非常適合鑒別，別是中藥紋圖譜的識別。
薄層色譜掃描儀不僅能成普通白光照射下的成像分析，再裝配254nm或365nm紫外燈后，也可以檢測異熒光，異熒光檢測。
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